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2019新型冠状病毒,即"SARS-CoV-2 (2019-nCoV)",基因组依次编码棘突蛋白(spike protein,SP)、包膜蛋白(Envelope protein,EP)、膜蛋白(Membrane protein,M)和核衣壳蛋白(Nucleocapsid,NP)。
棘突蛋白(spike protein) 是冠状病毒最重要的表面膜蛋白,含有两个亚基(subunit), S1和S2。其中S1主要包含有受体结合区(receptor binding domain, RBD),负责识别细胞的受体。S2含有膜融合过程所需的基本元件。
Spike 蛋白承担病毒与宿主细胞膜受体结合及膜融合功能,是宿主中和抗体的重要作用位点以及疫苗设计的关键靶点。SARS-CoV-2 (2019-nCoV) 的Spike蛋白与人ACE2互作来感染人的呼吸道上皮细胞。
核衣壳蛋白是冠状病毒中含量最丰富的蛋白。在病毒体组装过程中,N蛋白与病毒RNA结合并导致螺旋核衣壳的形成。核衣壳蛋白是一种高度免疫原性的磷蛋白,与病毒基因组复制和调节细胞信号通路有关。由于N蛋白的序列保守性和强大的免疫原性,N蛋白常被作为冠状病毒诊断检测工具。
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