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近期发表在JACS上的文章,题为:Combining Phage Display and Next-generation Sequencing for Materials Sciences: A Case Study on Probing Polypropylene Surfaces。这篇工作中,作者将噬菌体展示与高通量测序结合,鉴定出了能够与聚丙烯特异结合的多肽。文章的通讯作者是来自柏林洪堡大学的Hans G. Börner教授。
噬菌体展示(Phage Display, PD)是一种基于定向进化筛选高亲和力候选物的技术。外源多肽通过与噬菌体中特定蛋白融合表达,能够被展示在噬菌体表面。然后通过在受体上多次的吸附-洗脱-扩增淘洗过程,筛选出特异结合的多肽。这项技术在生物领域已经获得广泛的应用,在材料领域中也逐渐发挥重要的作用。但与取向明确的蛋白质受体相比,材料的表面具有更强的异质性(如图1所示),因此很难筛选获得单个特异的结合肽,而是一个更大的序列集。其中的单个序列仅能反映出材料表面局部的特征。
图1. 噬菌体展示筛选出的多肽的序列多样性与受体异质性相关
图2. Sanger测序与NGS测序的筛选过程示意图
图3. 多肽-PEG偶联物与聚丙烯的结合性质
(A) 8种筛选出的序列;(B) S8的变体
最后,作者测试了S8作为底漆的应用效果。分别在有无S8底漆的情况下用氰基丙烯酸酯胶黏剂进行不锈钢与聚丙烯的黏合。与未上底漆相比,黏合强度能够提高100%。
综上所述,作者利用噬菌体展示结合下一代测序的方法筛选出了特异性结合聚丙烯的多肽,并且有希望作为黏合的底漆提高聚丙烯的粘合强度。下一代测序的诸多优势对于筛选出高特异性的多肽以及揭示序列特征与功能的关系都具有重要意义。
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