多肽序列怎样书写?固拓生物教你正确书写多肽序列
作者:固拓多肽合成公司    发布于:2020年10月19日
摘要:一般多肽的写法有二种形式:单字母形式和三字母形式,无论是哪一种形式,所表述的多肽构造全是唯一的,以此来防止出现分歧。目前国际上统一的标准书写是多肽的N端(氮端)在最左侧,多肽的C端(碳端)在最右侧。

多肽序列怎样书写?固拓生物教你正确书写多肽序列

一般多肽序列的写法有二种形式:单字母形式和三字母形式,无论是哪一种形式,所表述的多肽构造全是唯一的,以此来防止出现分歧。目前国际上统一的标准书写是多肽的N端(氮端)在最左侧,多肽的C端(碳端)在最右侧。

 

一、多肽的单字母书写形式


什么是单字母?


简单来说是一个字母代表一个氨基酸,一般用大写字母表明,如A代表丙氨酸、C代表半胱氨酸。如果是小写字母的话,代表对应氨基酸是D型的,如小写字母字母a代表D型丙氨酸、小写字母字母c代表D型半胱氨酸。

 

多肽单字母书写举例说明

 

1.多肽1序列AGYFKVCM,共八个氨基酸,字母均是英文大写,表明全部的氨基酸均是纯天然存有的L型氨基酸。

2.多肽1序列AGYFKVCM还可以写出H-AGYFKVCM-OH,左侧的H-代表N端的氨基,可以写,可以省略。右侧的-OH代表C端的羧基,一样可以写,可以省略。但是一般为了美观齐整,H--OH另外写或不写。

3.多肽2序列AGYFkvcm,共八个氨基酸,右侧(C端)的四个氨基酸是小写字母,表明对应的四种氨基酸是和L型对称性的D型氨基酸。

4.多肽4序列:AGYFKVCM-NH2,与多肽1的差别是,右侧多了-NH2,代表着C端酰胺化。

 

二、多肽的三字母书写形式


什么是三字母?


是三个字母代表一个氨基酸,而且三字母和上文提及的单字母是一一对应关联。三个字母中,第一个字母大写,第二和第三个字母小写字母,如Ala也是代表丙氨酸、Cys代表半胱氨酸。

 

多肽三字母书写举例说明


1.多肽1序列对应的三字母书写为:H-Ala-Gly-Tyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH.

2.多肽3序列对应的三字母书写为:H-Ala-Gly-Tyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-NH2C端酰胺化。

 

三、独特氨基酸书写,下边介绍一些常见的书写


1.N端封端的书写,一般是乙酸封端,书写为Ac-Ala-Gly-Tyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH.

2.磷酸化氨基酸的书写

H-Ala-Gly-pTyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH

H-Ala-Gly-Tyr(PO3H2)-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH,数字32采用下标

 

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