定制合成 Custom synthesis
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肽库是大量具有特定长度和不同序列的小肽的集合,包括这种长度的短肽中各种(或大部分)氨基酸序列的排列组合。肽库最早是由Geyson等人于1986年提出的。他们认为蛋白质分子之间的结合或识别主要是由局部肽段上的几个氨基酸残基相互作用完成的,这些氨基酸形成非共价键;虽然有些多肽的序列与抗原的天然表位不同,但结合抗体或配体的方式是相同的,所以这种带有关键氨基酸残基的多肽称为模拟表位。模拟表位的概念对肽库的发展起着重要的推动作用。肽库可以为药物设计、蛋白质相互作用等生化和药物研究应用提供有力的工具。
(1)基于已知结构的定制肽库。
在已知化合物结构的基础上,通过以下方法构建和设计了一系列多肽,并对目标化合物的功能和适应症进行了筛选,以期获得具有靶向药效的新分子或结构。
n端、C端、侧链修饰:酰化、酯化、聚乙二醇化、β-氨基酸取代、D-氨基酸取代、主链氨基甲基化、二硫键取代、构象锁定(螺旋、β-片)、镜像多肽、环肽(端对端环化、侧链环化)、特殊分子标记、羟基酸取代。
(2)噬菌体展示肽库。
人工合成编码随机多肽片段的基因,然后将这些基因克隆到噬菌体载体中。利用噬菌体表位展示技术将多肽展示在噬菌体表面,构建了多肽文库。筛选时,根据特异性受体靶标与肽库中某些多肽的特异性相互作用,从文库中筛选出与特异性靶标结合的多肽。
(3)一株一物化学组合多肽库。
组合库是通过在树脂上随机合成多肽来合成数千个多肽的多肽文库。例如,5肽库中有55个五肽,9肽库中有99个九肽。然后根据特异性受体靶标与肽库中某些多肽的特异性相互作用,筛选出与特异性靶标结合的多肽。
(4)DNA编码的化学组合多肽库。
载体树脂上的随机合成肽含有由数千个多肽和DNA合成的DNA组成的肽库,其中合成了几个核苷酸来编码每个氨基酸的多肽。筛选时,受体靶标需要连接一个荧光分子。如果多肽与受体结合,相应的树脂就会发出荧光。然后,将这些荧光树脂作为聚合酶链反应扩增的模板,然后测序以获得多肽信息。
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