肽键平面的构成
作者:固拓多肽合成公司    发布于:2022年07月05日
摘要:肽键中六个原子C、H、O、N、Cα1、Cα2具有一定的双键特征,不能自由旋转,这些现象是由共振引起的。结果是肽键处于一个刚性平面上,这个平面是肽平面,也称为酰胺平面。两个肽键平面之间的α-碳原子可以作为旋转点形成二面角。二面角的变化决定了多肽主键在三维空间中的排列,这是形成不同蛋白质构象的基础。

酰胺平面

肽键中六个原子CHONCα1Cα2具有一定的双键特征,不能自由旋转这些现象是由共振引起的。结果是肽键一个刚性平面上这个平面是肽平面,也称为酰胺平面。两个肽键平面之间的α-碳原子可以作为旋转点形成二面角。二面角的变化决定了肽主键在三维空间中的排列,这是形成不同蛋白质构象的基础。

肽平面中的N原子是sp3等性杂化,具有三个键电子,最初与氢原子呈三角结构。但是结合肽平面是由于空间效应,即N上的未成键电子与CO共轭。因此不能任意旋转它,因此它形成一个平面。

肽平面的范围

肽平面围绕N-Ca键的旋转角度用F表示,而围绕Ca-C1键的旋转角度用Y表示,顺时针方向为正,反时针为负。理论上,FY可以在-180°和+180°之间的任何角度上取。生物物理学家G.N.Ramachandran等人构建了一个空间填充肽模型,并计算了多肽链FY维度上的允许值。用Y绘制F可以得到一个二维图,称为Ramachandran构象图。

肽键平面的构成

二面角

围绕Cα-N键轴旋转的二面角(C-N-Cα-C)称为φ,围绕Cα-C键轴旋转的二面角N-Cα-C-N)称为ψ,因此多肽链主链的可能构象可以用φ和ψ两个二面角或扭角来描述。ψ的最大允许范围为-71&ORDM-22º;)或20º-+180º;)φ的最大允许面积为-180º--45º;)

写到最后:

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