氨基酸消旋机理
作者:固拓多肽合成公司    发布于:2023年02月08日
摘要:多肽API中氨基酸racemization产生的diastereomer(非对映异构体)杂质,大部分来自多肽合成中氨基酸活化/偶联过程。目前多肽API的原料大多是Fmoc-Xaa-OH氨基酸,氨基酸羧酸基团活化后可诱导Oxazol-5(4H)-one中间体的形成

多肽API中氨基酸racemization产生的diastereomer(非对映异构体)杂质部分来自多肽合成中氨基酸活化/偶联过程。目前多肽API的原料大多是Fmoc-Xaa-OH氨基酸,氨基酸羧酸基团活化后可诱导Oxazol-5(4H)-one中间体的形成。在此过程中形成的Oxazol-5(4H)-one中间体被认为是肽合成中氨基酸外消旋化的主要来源。oxazol-5(4H)-one调节氨基酸外消旋化的机制见下图。

氨基酸消旋机理 

在这一机制中,N-酰化氨基酸图中 1 在其羧基上被相应的偶联剂激活并转化为活性对应物图中 2、它将部分转化为相应的oxazol-5(4H)-one衍生物图中 3,并保留Cα的手性。尽管中间体 图中也对氨基酸 图中4 具有反应性的目标肽构建 图中5、但衍生物的外消旋化比目标反应更快。图中上的Hα在这个过程中,被碱带走了,于是图中转化为相应的oxazol-5(4H)-one阴离子图中 6、后者可以通过resonance转换为 图中7图中 8oxazol-5(4H)-one阴离子图中 6 当它被质子化时,外消旋化就会发生,外消旋混合物可以与反应物相匹配 图中4 收缩,生成非对映异构体图中 10。图图中它暗示了racemization的前提条件之一是通过oxazol-5(4H)-one中间体的形成,这是氨基酸的Nα以酰基替代基(乙酰基、苯甲酰基、肽基等)为先决条件。实际上,通过Nα-氨基甲酸酯保护的氨基酸构件,如Fmoc-Xaa-OHBoc-Xaa-OH,完全抑制其在多肽合成过程中的外消旋化副反应,特别是对于高倾向的氨基酸反应物,仍然是不现实的。

写到最后:

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