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这类抗菌肽最开始是由虫类哺乳类、两栖类等等的防御体系中分化获得的,其主要包含4类:
1.杀菌肽(cecropin)最开始是由西哥罗佩蛾(Cecropiamoth)的免疫淋巴中存在,它们主要存在于其它虫类中,并且在猪肠中也发现相似的杀菌肽。它们有一个典例特点是在一个长的疏水片段后边接有有一个强碱性的N-端区域。
2.爪蟾抗菌肽爪蟾抗菌肽(magainin)来源于蛙的肌肉和胃内。结构研究发现,爪蟾抗菌肽也呈螺旋构型,尤其是在疏水环境下。使用N-标识的固相NMR研究爪蟾抗茵肽在脂两层里的构型,基于酰氨共振的化学位移,显示出爪蟾抗菌肽的螺旋是平行双分子层表面,它们汇聚能够形成一个13mm的笼,且具有有一个30mm的周期性螺旋结构。
3.防卫肽防卫肽(defensin)来源于人多核具有完全核分叶的嗜中性白细胞兔多聚巨噬细胞及其动物的肠细胞中。从虫类之中提取到了一组类似于哺乳类防卫肽的抗菌肽,称做“虫类防卫肽”。与哺乳类的防卫肽不一样,“虫类防卫肽”只对革兰氏阳性菌有活性。即使虫类防卫肽也含有6个Cys残基,但彼此之间的二硫键连接方法则不同。从果蝇中提取的抗菌肽分子内二硫桥结合方式与植物防卫肽一样。在晶体条件下,防卫肽以两聚体形式呈现。
4.Tachyplesin是由马蹄蟹(horseshoecrab)中分化到的。构型研究表明它采用反平行的B-折叠式构型(3~8位、11-16位),其中以β-转角相互连接(8~11位),还会在7和12位、3和16位间产生两个二硫键。在这个结构上,疏水的氨基酸被定位在平面的一侧,六个阳离子残基则出现在分子尾端,所以,它的结构也是双嗜性的。
由此可以得出,即使这类抗菌肽在长短上天差地别但几乎所有抗菌肽在本质上就是阳离子型的;在高端结构上,不管是以α-螺旋或是β-折叠式形式呈现,双嗜性结构是它们共同特征。
写到最后:
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