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经常使用的多肽的书写有两种类型——单字母和三字母方式。不管是哪一种方式书写。只要同属于一条肽链,则它要表达的多肽结构便是相同的。书写出的多肽序列不只是自己可以懂得,让他人也可以正确认识。为防止出现解析争论;国际上一致规定:多肽的N端(氨基端)在最左边,多肽的C端(羧基端)在最右边。
多肽的单字母书写形式
简单来说就是一个字母表示一个氨基酸(便于记录和书写)。氨基酸的单字母选取并不是随便的。目前通用的单字母规则主要是比较常见的20种氨基酸,氨基酸用大写字母(L-氨基酸)表示。例如A表示L-丙氨酸(Alanine)、C表示L-半胱氨酸(Cysteine)和G表示L-甘氨酸(Glycine)。倘若氨基酸的结构变化,例如D-丙氨酸(Alanine),在用单字母表示时,我们则用小写字母表示。例如D-丙氨酸(Alanine)用a表示,D-异亮氨酸(Isoleucine)用i表示和D-甲硫氨酸(Methionine)用m表示。
多肽序列单字母书写举例
①多肽序列1:GTFLVRCDMA,共10个氨基酸,所有字母均是大写,则表示所有的氨基酸均是天然存在的L型氨基酸。
②多肽序列2:GTFLvRCdMA,共10个氨基酸,序列里面有两个氨基酸是小写,说明对应的两个氨基酸是D型氨基酸。
③多肽序列1:GTFLVRCDMA也可以写成H-GTFLVRCDMA-OH,左边的H-代表N端的氨基,右边的-OH代表C端的羧基。不过一般通常为了美观整齐,H-和-OH同时写或同时不写。
④多肽序列3:GTFLVRCDMA-NH2,与多肽序列1的区别是,右边多了-NH2,代表C端酰胺化。
⑤多肽序列4:AC-GTFLVRCDMA,与多肽序列1的区别是,左边多-AC,代表N端乙酰化。
多肽的三字母书写方式
什么叫三字母?
简单来说就是三个字母代表一个氨基酸,并且三字母和前面提到的单字母是一一对应关系。三个字母中,第一个字母大写,第二和第三个字母小写,如丙氨酸(Alanine)用Ala表示、半胱氨酸(Cysteine)用Cys表示。
多肽三字母书写举例
①多肽序列1对应的三字母书写为:H-Gly-Thr-Phe-Leu-Val-Cys-Asp-Met-Ala-OH.
②多肽序列3对应的三字母书写为:H-Gly-Thr-Phe-Leu-Val-Cys-Asp-Met-Ala-NH2,C端酰胺化。
③多肽序列4对应的三字母书写:Ac-Gly-Thr-Phe-Leu-Val-Cys-Asp-Met-Ala-OH左边多-Ac,代表N端乙酰化。
特殊多肽序列的书写
例如:磷酸化氨基酸的书写
①:H-Gly-pThr-Phe-Leu-Val-Cys-Asp-Met-Ala-OH
②:H-Gly-Thr(PO3H2)-Phe-Leu-Val-Cys-Asp-Met-Ala-OH
写到最后:
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